经过多次改制，2000年，汇集了上海中药制药一、二、三厂的大部分优质资源的“上海雷允上药业有限公司”成立，该公司是上海市药材有限公司的子公司。

　　在上海市药材有限公司董事长、总经理，上海雷允上药业有限公司董事长陈军力看来，继承了建国以来上海中药制药业衣钵的上海雷允上，可谓“中国现代中成药工业的摇篮”。卫生部原部长陈敏章也曾专门为雷允上题词：“名声如雷，允称上乘”。

　　经典品牌的传承与创新

　　谈到上海雷允上的发展规划，陈军力用了两个词来概括：“传承”与“创新”。　　

　　提到传承，就不能不说雷允上的标志性药物：六神丸。苏沪之地气候湿热，易发瘟疫，温病流行高发。1862年,六神丸诞生于上海，对治疗温病有奇效，拯救了千万百姓的生命。　

　　当时北京同仁堂的中药大多以大丸的形式作为宫廷用药，而雷允上的六神丸是微丸的形式，药量小，价格便宜，专门用于为老百姓防病治病。

　　六神丸一经问世就享有盛名，其微丸制作技艺是雷允上独到的，包括对原药材的处理，都有其独特的特点。六神丸从选材到泛丸到最后成型均是以人工来完成。泛丸是中药的传统工艺，但要泛制成如六神丸这样小如芥子的丸药，一般的药厂是做不到的。

　　因此，六神丸被国家列为一级保密配方，为国家机密；同时，其制作技艺已于2011年5月入选国家级非物质文化遗产。它的配方，至今也只有“非遗”继承人一人了解。

　　历史上，六神丸主要用于温病、传染病的治疗，通过现代的研究，以西医的观点来看，其药性是抗菌消炎，因而又有“中药抗生素”之称。陈军力告诉《新民周刊》：雷允上正在努力扩大它的临床应用，通过药理分析，用循证医学的手段，在当前国家卫生部门“限抗令”之下，希望能用它替代部分抗生素的作用。

　　当前，人体对抗生素的抗药性越来越强，这也是国家下令限制抗生素使用的重要原因。当然，中药也存在抗药性。回顾典籍可以发现，明代李时珍编著的《本草纲目》较之比它早一千多年的《神农本草》而言，记载的药物是有所淘汰的，那么说明很可能人体对这些药物已经产生抗药性。

　　然而，六神丸自发明以来已历150多年，临床效果一直很好，这证明六神丸的耐药性是比较小的，并且与抗生素相比，其副作用也很小。“很可能再过一百年还有用。”这样的优势是抗生素无可比拟的。　

　　陈军力表示，在创新方面，雷允上目前没有做太多新药的开发，而是把更多精力放在已有药品的二次开发、提升品质上。例如对目前销售额最大的丹参片，雷允上持续提升产品标准，使之大大高于国标。并且，雷允上已经建立起丹参原料的完全可追溯系统，这意味着丹参的种植地在哪里、什么时候施过什么肥料、采摘后流通的路径、生产的流程等等数据，都可以一一被追溯。同时，雷允上在山东还建立起了自己的丹参种植基地，进行品种选育。应用这套追溯系统和选育技术的还有猴头菌。　

　　这些创新，能保证产品质量的均一性、稳定性。雷允上深知，提升产品品质，是大众健康的需要，因而是自己的使命。

　　从“美谷”走向世界

　　2000年初，雷允上就开始考虑入驻奉贤，地理位置、服务优势等因素是雷允上做出选择的原因。

　　2002年，列为国家计委中药现代化重大专项的上海雷允上药业“中药复方提取物先进生产工艺高技术产业化示范工程”